巴香冒菜的起源說法有很多種。巴香冒菜的初次起源于四川鹵菜，四川的鹵菜、涼拌菜味滿天下，很多懶人為了方便，但是又想節約，于是就直接在市場上買加工成熟的熟食。因為鹵菜要用鹵水，但是店家又怕鹵水中的油水浪費，于是乎就在里邊加入一些香料和中藥，放一些蔬菜進行燙，發現味道很好。就和涼菜一起銷售，起到非常好的感覺，于是便有了巴香冒菜。
另外一種說法是巴香冒菜的初次起源于漢末三國時期，在西漢時，由于井鹽的大量開采和使用，川人“尚滋味，好辛香”的飲食習慣已經初步形成。西漢人左思在《蜀都賦》中就有“調夫五味”，甘甜之和，......五肉七菜，朦厭腥臊，可以練神養血者，莫不畢際”的記載，調夫五味講的就是中藥調味方式。
在東漢末年由于連年征戰軍隊中出現了各種身體有恙，士兵沒有食欲；軍醫為防止身體有恙在軍隊中蔓延且起到很好的感覺命伙夫就經常在飯菜中加入一些中藥即能防病、治病、又能產生香味，達到調味的目的；因這此用藥大部分都有調味用后城做鹵料。后來經過伙夫的改良將各種蔬菜進行燙，發現味道比之前味道更好、更受到軍中將士喜愛。便將此法在軍中廣為傳播，因軍隊中量比較大，多以香料熬湯燙食之曰“巴香冒菜”。后來伙夫年邁離開軍隊，便將此法帶入民間以經營“巴香冒菜館”為生，生意異常不錯。由此巴香冒菜進入盛大的繁榮昌盛時期。
總之，不管各種說法巴香冒菜的起源都和四川這個美食聚集地息息相關的，巴香冒菜起源于四川是肯定的。巴香冒菜經過多種改良有當初的一種鹵味型巴香冒菜轉變為更多、更適合各地人群喜愛的口味如：火鍋型巴香冒菜、清湯巴香冒菜、微辣巴香冒菜、特辣巴香冒菜以及傳統的鹵味巴香冒菜。
